Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc5a6Q5U4D8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms