Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf1Q5U4C3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf1Q5U4C3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms