Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sft2d1Q5SSN7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms