Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc27Q3V036 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc27Q3V036 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms