Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a11Q3USY0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc38a11Q3USY0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms