Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctsll3Q3ULP7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctsll3Q3ULP7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms