Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp19Q3UJD6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp19Q3UJD6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms