Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnep1r1Q3UJ81 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms