Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmem88bQ3TYP4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88bQ3TYP4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms