Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne9Q1RLL3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms