Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo3bQ1EG27 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo3bQ1EG27 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo3bQ1EG27 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo3bQ1EG27 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo3bQ1EG27 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo3bQ1EG27 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo3bQ1EG27 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo3bQ1EG27 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo3bQ1EG27 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo3bQ1EG27 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo3bQ1EG27 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms