Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCF4Q15080 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms