Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Traf3ip1Q149C2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf3ip1Q149C2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms