Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	OST5	YGL226C-A	261 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SCM4	YGR049W	564 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	LST7	YGR057C	729 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YHR182C-A	YHR182C-A	474 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RPL8B	YLL045C	771 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	snR11	snR11	258 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	IPP1	YBR011C	864 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	GIS4	YML006C	2325 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	ITT1	YML068W	1395 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	AI4	Q0065	1671 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	TFC1	YBR123C	1950 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	CSR2	YPR030W	3366 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YCR099C	YCR099C	468 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YDR491C	YDR491C	492 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RSM27	YGR215W	333 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	PIR1	YKL164C	1026 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	TEM1	YML064C	738 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RUF5-1	RUF5-1	710 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	RUF5-2	RUF5-2	710 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	CUP9	YPL177C	921 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SLM4	YBR077C	489 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YME2	YMR302C	2553 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SPO71	YDR104C	3738 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	CCM1	YGR150C	2595 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	MRH1	YDR033W	963 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	BMH2	YDR099W	822 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SPT2	YER161C	1002 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YFR010W-A	YFR010W-A	189 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	PCD1	YLR151C	1023 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	SAS5	YOR213C	747 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YOR366W	YOR366W	354 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	DIM1	YPL266W	957 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YPR027C	YPR027C	834 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	YSP2	YDR326C	4317 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	MAK21	YDR060W	3078 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	ROG1	YGL144C	2058 nt		3.47	□□□□□ -1.85
MRD1	Q06106	Q0255	Q0255	1419 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	PEX10	YDR265W	1014 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YEL075C	YEL075C	369 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	COX6	YHR051W	447 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	RPC37	YKR025W	849 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YBL065W	YBL065W	345 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	THI80	YOR143C	960 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	DGA1	YOR245C	1257 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	PPT2	YPL148C	522 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YAT2	YER024W	2772 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	PSP1	YDR505C	2526 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	PBS2	YJL128C	2007 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YKL222C	YKL222C	2118 nt		3.46	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	SAG1	YJR004C	1953 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	DUN1	YDL101C	1542 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	VIP1	YLR410W	3441 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	CLB3	YDL155W	1284 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	GUK1	YDR454C	564 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	NNF1	YJR112W	606 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YBL028C	YBL028C	321 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	RIM9	YMR063W	720 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YMR294W-A	YMR294W-A	360 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YOR203W	YOR203W	354 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	POL30	YBR088C	777 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	POL2	YNL262W	6669 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	VPS9	YML097C	1356 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	ROM1	YGR070W	3468 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	FLO1	YAR050W	4614 nt		3.45	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	ARG2	YJL071W	1725 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	ENP2	YGR145W	2124 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YDL242W	YDL242W	354 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	HTA1	YDR225W	399 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	GRX2	YDR513W	432 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	RPL23B	YER117W	414 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	NSA2	YER126C	786 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	MIG2	YGL209W	1149 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YMR141C	YMR141C	309 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YNR062C	YNR062C	984 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YGR237C	YGR237C	2358 nt		3.44	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	ENA5	YDR038C	3276 nt		3.43	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	RCY1	YJL204C	2523 nt		3.43	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	HRD1	YOL013C	1656 nt		3.43	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	ATP25	YMR098C	1839 nt		3.43	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	RPC25	YKL144C	639 nt		3.43	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	SFH1	YLR321C	1281 nt		3.43	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	PEX11	YOL147C	711 nt		3.43	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	TLC1	TLC1	1301 nt		3.43	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	IOC3	YFR013W	2364 nt		3.43	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	UTP5	YDR398W	1932 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	ATP16	YDL004W	483 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	HMF1	YER057C	390 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	PPX1	YHR201C	1194 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	NNT1	YLR285W	786 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YLR416C	YLR416C	399 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	OST6	YML019W	999 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	UNG1	YML021C	1080 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YBL029C-A	YBL029C-A	285 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	RPL13B	YMR142C	600 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YBL055C	YBL055C	1257 nt		3.42	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms