Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs2Q03350 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms