Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NfiaQ02780 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms