Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Muc1Q02496 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Muc1Q02496 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms