Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Arf1P84078 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf1P84078 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms