Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx1P82976 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx1P82976 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx1P82976 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx1P82976 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx1P82976 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx1P82976 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx1P82976 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbx1P82976 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbx1P82976 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx1P82976 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms