Protein–RNA interactions for Protein: P70348

Gcm1, Chorion-specific transcription factor GCMa, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm1P70348 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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