Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfixP70257 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfixP70257 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfixP70257 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfixP70257 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfixP70257 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfixP70257 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfixP70257 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfixP70257 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfixP70257 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfixP70257 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfixP70257 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NfixP70257 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfixP70257 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfixP70257 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfixP70257 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfixP70257 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfixP70257 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfixP70257 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NfixP70257 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms