Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtnP63089 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtnP63089 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtnP63089 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtnP63089 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtnP63089 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtnP63089 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtnP63089 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtnP63089 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtnP63089 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtnP63089 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtnP63089 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtnP63089 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms