Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms