Protein–RNA interactions for Protein: P62627

Dynlrb1, Dynein light chain roadblock-type 1, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dynlrb1P62627 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dynlrb1P62627 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dynlrb1P62627 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dynlrb1P62627 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dynlrb1P62627 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dynlrb1P62627 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dynlrb1P62627 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dynlrb1P62627 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dynlrb1P62627 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dynlrb1P62627 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dynlrb1P62627 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms