Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copz1P61924 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copz1P61924 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Copz1P61924 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Copz1P61924 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copz1P61924 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copz1P61924 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms