Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Polr3bP59470 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Polr3bP59470 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms