Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CgnP59242 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CgnP59242 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CgnP59242 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CgnP59242 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CgnP59242 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CgnP59242 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CgnP59242 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CgnP59242 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CgnP59242 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CgnP59242 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CgnP59242 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CgnP59242 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CgnP59242 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CgnP59242 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CgnP59242 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CgnP59242 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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