Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms