Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace1P56818 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bace1P56818 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bace1P56818 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bace1P56818 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bace1P56818 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bace1P56818 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bace1P56818 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace1P56818 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace1P56818 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace1P56818 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Bace1P56818 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Bace1P56818 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace1P56818 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bace1P56818 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bace1P56818 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Bace1P56818 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms