Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgf9P54130 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgf9P54130 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms