Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms