Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx4P53776 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx4P53776 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms