Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fgd1P52734 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms