Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx2-1P50220 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms