Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms