Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc1P34928 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms