Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KrasP32883 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KrasP32883 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KrasP32883 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KrasP32883 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KrasP32883 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KrasP32883 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KrasP32883 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KrasP32883 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KrasP32883 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KrasP32883 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms