Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp2P29594 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp2P29594 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms