Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dusp1P28563 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms