Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr1P16092 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr1P16092 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms