Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf1P07141 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csf1P07141 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms