Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06323 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06323 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06323 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06323 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06323 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06323 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06323 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06323 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06323 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms