Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna2P01573 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifna2P01573 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna2P01573 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna2P01573 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna2P01573 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna2P01573 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna2P01573 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms