Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abl1P00520 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abl1P00520 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abl1P00520 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abl1P00520 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abl1P00520 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abl1P00520 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abl1P00520 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abl1P00520 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abl1P00520 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abl1P00520 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abl1P00520 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abl1P00520 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abl1P00520 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abl1P00520 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abl1P00520 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abl1P00520 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms