Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Setdb1O88974 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setdb1O88974 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb1O88974 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms