Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb5O55234 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb5O55234 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms