Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn20O55082 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms