Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk2a2O54833 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms