Protein–RNA interactions for Protein: O54718

Irs3, Insulin receptor substrate 3, isoform CRA_a (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irs3O54718 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irs3O54718 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irs3O54718 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irs3O54718 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms