Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab33bO35963 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab33bO35963 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms